可以说，在设计建造“长江”号的时候，顾祝同就表现出了卓越的工程管理能力。
显然，让他来负责载人登月项目确实是最佳选择。
虽然并非没有能够与他同样厉害的管理者，但是在管理政府工程上，顾祝同绝对比任何人都要出色。
载人登月项目启动之后。顾祝同做的第一件事情就是搭建管理框架。
按照他的要求，载人登月项目被拆分成了五个子项目，即运月球飞船、运载火箭、发射场地、工程制造与后勤运输。这五个子项目都有各自的总工程师与项目总经理，总工程师负责处理技术问题，而项目总经理则负责项目运作。顾祝同并不过问项目的具体情况，只给总工程师与总经理安排任务，并且要求总工程师与总经理签下军令状，然后就是不择手段的去达到目的。
显然，在顾祝同手下做事肯定很辛苦，但是只要把事情办好了。就肯定能尝到甜头。
比如，钱仲三出色的完成了其工作之后。不但获得了国家科技进步特等奖，如愿以偿的成为了中国工程院与中国科学院的双料院士，还在中国航天集团公司担任总工程师，获得的奖金更是难以计数。
当然，像钱仲三这样的科学家，把钱看得很淡，他们要的是名。以及科研成就。
在载人登月工程中，总共有十二人担任过总工程师、十四人担任过总经理，而这二十六人中。后来有七人成为了部长级官员，九人获得了院士身份，八人在国内大型航空航天企业担任高管。
这些，都与顾祝同有关。
这就是，只要出色的完成了工作，顾祝同就会给他们一封亲笔推荐信，而这封心就是获得事业成功的保证。
可以说，在管理方面，顾祝同确实很有才华。
此外，顾祝同还非常重视技术。虽然顾祝同并不懂技术，在他拥有的众多头衔中，绝对没有“技术专家”这个头衔，而且即便与海军有关的技术，顾祝同的了解都不多，但是这并不表示顾祝同不重视技术。
事实上，顾祝同是中国第一批技术型将领中的领军人物。
在担任海军参谋长期间，顾祝同就格外重视技术。事实上，在大战期间，顾祝同就极为重视技术兵器。